第二次：受“两陈事件”牵连
 
1950年6月至1951年6月，谢育才任解放后第一任汕头市市长，兼中共汕头市委委员。他在狱中丢下的孩子谢继强，被特务头子庄祖方收养。解放前夕，庄带着孩子逃到香港。解放初，广州市公安局进行策反工作，与庄祖方建立了联系。经中共中央华南分局书记叶剑英同意，孩子回到了谢育才身边。
 
没想到，公安局策反庄祖方不久后被错误地认定为“与敌特勾结”，广州市公安局首任正、副局长陈泊、陈坤受到开除党籍、逮捕、监禁等严厉处理（1980年平反），谢育才也因此受到牵连。
 
组织上怀疑谢育才是受敌特之意而“潜伏”下来的，再次严厉审查，开除党籍。
 
第三次：“文革”被定为叛徒
 
十年浩劫期间，谢育才第三次被开除党籍，并被定为“叛徒”。谢育才临终时，呐喊：恢复我中国共产党党籍，恢复我1926年入党以来的党龄！
 
1999年1月8日，中共广东省纪委发出文件，恢复谢育才1926年至1945年的党籍党龄。