为了在哈尔滨平房区建造6000㎡的实景剧组花8000万搭建了可拆卸的“人体实验区”。哈尔滨冬天零下32度，演员得穿单衣拍8小时，有的演员手指冻得又肿又变形；

为了呈现受害者被抽干脊髓的惨状特效团队用硅胶模拟人体组织，配合液压装置做出“血肉剥离”的效果。剧组甚至复原了日军销毁罪证时的焚烧场景3000℃的高温下，实验器材熔成铁水，空气中满是刺鼻的焦臭味。

投资方集体撤资后赵林山抵押房产借了2000万维持拍摄。最困难的时候，剧组在青岛东方影都的摄影棚里吃住工作，靠泡面充饥。

为了说服姜武演男主角，导演连续72小时陪他在零下20度的户外背台词，最后用“用生命换真相”的信念打动了他。这种近乎偏执的坚持，让影片成本从最初预估的1.2亿涨到了3.8亿。

影片有37处血腥镜头包括活体解剖、性暴力实验等，广电总局初审时要求删减18处“过度暴力”的片段，导演团队却以“历史真实性优先”据理力争最后保留了关键的证据性画面。